韩方普研究组在小麦着丝粒研究中取得新进展
发布时间:2023.12.08
普通小麦是全球最主要的粮食作物之一,其形成涉及三个祖先种的两次远缘杂交和异源多倍化过程。小麦基因组大小约16 Gb,包含A、B和D三套既高度同源又有明显分化的亚基因组,其中90%以上为重复序列。普通小麦具有良好的可杂交性,可以与多种近缘野生种进行杂交,由此引入野生资源的优异性状,有效改良小麦的农艺性状。普通小麦着丝粒主要由卫星重复序列和反转座子组成,平均大小约8 Mb。不同倍性小麦参考基因组、大规模重测序以及多组学数据的发表为小麦着丝粒的研究提供了重要的基因组资源。
远缘杂交和异源多倍化是指物种通过种属间杂交和全基因组加倍,使多套染色体在同一细胞核内稳定遗传的现象,是新物种形成和生物多样性重要的驱动力之一。远缘杂交可以拓宽作物基因库的遗传多样性,改良作物关键农艺性状甚至创造新物种,具有不可替代的作用和独特优势。研究表明作物远缘杂交和异源多倍化早期世代会经历不同程度的基因组冲击,并伴随染色体数目和结构的异常,产生染色体重排以及单亲染色体丢失等核型不稳定现象。因此,对远缘杂交过程不同亲本来源染色体组的稳定和适应机制进行研究,有助于克服种间隔离,实现种质资源更高效、广泛的利用。
中国科学院遗传与发育生物学研究所韩方普研究组长期从事小麦远缘杂交与染色体工程育种工作。前期利用小麦远缘杂交材料,详细研究四倍体长穗偃麦草的起源及快速二倍化(Shi et al., Plant J., 2023)。同时,也利用二倍体及四倍体长穗偃麦草的优良基因用于小麦赤霉病抗性遗传改良(Guo et al., Plant J., 2023)。本研究在前期工作的基础上从头创制一系列人工合成小麦材料,探索不同基因组着丝粒瞬时适应远缘杂交和异源多倍化的方式,解析多倍体基因组核型稳定的机制,为其他多倍体作物及潜在野生近缘种着丝粒的重新驯化奠定基础。
通过人工创制一系列四倍体和六倍体合成小麦材料来模拟自然界小麦多倍化过程,并通过着丝粒特异组蛋白CENH3抗体进行ChIP-seq试验,结果显示在小麦-山羊草合成材料F1、S0、及有限世代连续自交过程中,着丝粒CENH3的装载相对亲本稳定(图)。说明面对基因组冲击人工合成异源多倍体小麦早期世代着丝粒CENH3渐进式进化方式的普遍性,为理解异源多倍体早期基因组相对稳定提供保证机制。
该研究成果以“Wide hybridizations reveal the robustness of functional centromeres in Triticum-Aegilops species complex lines”为题于2023年12月7日在线发表于Journal of Genetics and Genomics(DOI:10.1016/j.jgg.2023.12.001),韩方普研究组已毕业博士研究生黄宇虹为该文章的第一作者,韩方普研究员和华中农业大学苏汉东教授为共同通讯作者。该研究得到国家重点研发计划项目(2022YFF1003303)、国家自然科学基金项目(31991212)的资助。
图:小麦-山羊草人工合成材料着丝粒的适应性进化
A.杂交对着丝粒定位的影响。B. 多色FISH技术鉴定合成小麦材料。
C. 杂交和多倍体化对着丝粒定位的影响。D. 合成四倍体小麦代际间CENH3装载稳定。
E. 高代合成小麦核型稳定。F. 高代合成小麦7号染色体着丝粒的适应性进化。