为落实中国科学院加强与国家创新体系各单元联合与合作的精神，依据研究所创新三期的战略部署和双方实际研发需求，中国科学院遗传与发育生物学研究所和新疆农垦科学院共建“中科院遗传发育所新疆农垦科学院分子农业技术育种中心”于2006年5月26日正式成立。签约仪式在遗传发育所中关村园区举行。
参加签约仪式的有新疆农垦科学院的尹飞虎书记、新疆生产建设兵团科技局田笑明局长、新疆农垦科学院的李云峰院长助理、谢宗铭博士和遗传发育所薛勇彪所长、张爱民副所长、杨维才所长助理、姚庆筱所长助理、陈受宜研究员、陈凡研究员、储成才研究员、曹殿文处长等参加了签约仪式。张爱民副所长主持了签约仪式。
遗传发育所薛勇彪所长和新疆农垦科学院的尹飞虎书记分别代表各方签署了共建“中科院遗传发育所新疆农垦科学院分子农业技术育种中心”合作协议书并发表了讲话。
尹飞虎书记强调，在充分发挥双方各自的优势，通力合作的基础上，有信心将“分子农业技术育种中心”做实、做大、做强。薛勇彪所长表示该中心的成立为双方扎实合作搭建了重要平台，是启动创新三期的良好开局。通过双方共同努力，一定要把中心做实，为新疆的农业发展做贡献。
“分子农业技术育种中心”以棉花为研发的主要目标作物，通过遗传发育所在基础研究理论、自主知识产权和分子育种技术等方面的优势与新疆农垦科学院常规育种和推广体系的优势相结合，选育符合农业生产实际需求的具备抗旱、抗寒、抗冻、早熟、高产等综合优势性状的棉花新品种，促进遗传发育所基础研究和技术成果向现实生产力转化，提高新疆农垦科学院的科研能力和水平，逐步使"分子农业技术育种中心"发展成为独具区域特色的棉花高新技术育种研究、开发与成果转化的创新载体。