NGS测序和大型动植物基因组组装(时间:2012年3月26日下午2:00)

报告内容:

  基因组组装是生物信息学领域里最具挑战的课题之一。二代测序的高通量、短读长又为组装和拼接带来新特点和挑战。本次报告主要内容:

  1、三种常用的拼接算法以及目前流行的组装软件包;

  2、在Tasmanian Devil基因组项目中,介绍组装过程以及如何将Scaffold定位染色体;

  3、毛竹、芒草等大型植物基因组拼接。

 

报告题目:NGS测序和大型动植物基因组组装

报告时间:2012年3月26日(星期一)下午14:00

报告地点:1号楼210报告厅

 

报告人简介:

  宁泽民博士,现任职英国Wellcome Trust Sanger Institute,任Senior Scientific Manager。宁博士出身于工程和物理学背景,近10多年来从事生物信息软件开发和基因组数据分析。负责和参与了多项广泛应用的软件如SSAHA/SSAHA2、ssahaSNP、Pindel以及Phusion等的开发,并参与人、小鼠、斑马鱼等国际基因组计划。

 

联系人:孟菲 

联系电话:64873428

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