姓  名: 靳帅
    职  称: 研究员
    职  务:
    电话/传真:
    电子邮件: jinshuai@genetics.ac.cn
    实验室主页:
    研究方向: 遗传元件挖掘与基因组编辑育种

    简历介绍:

    靳帅,博士,研究员,博士生导师
        2016年,山东农业大学学士;2021年,中国科学院遗传与发育生物学研究所博士;2021-2023年,中国科学院遗传与发育生物学研究所博士后(特别研究助理);2023-2026年,清华大学生命科学学院博士后(水木学者)。2026年,入职中国科学院遗传与发育生物学研究所育种前沿技术实验室。曾获吴瑞奖学金、中国科学院院长特别奖、中国科学院优秀博士学位论文等奖励。研究成果以第一作者/共同第一作者身份发表于Science、Cell、Nature Biotechnology、Molecular Cell等期刊。长期从事基因组编辑相关研究,过往工作聚焦于基因组编辑酶的进化起源、特异性与工具开发。未来,研究组将融合基因组编辑、人工智能、生物信息学、进化生物学和结构生物学等多学科手段,开展从遗传元件挖掘到作物性状设计的创新研究。

    研究领域:

    主要研究领域:
        1. 酶挖掘方法创新与核酸操纵机制解析。创新遗传元件挖掘方法,挖掘具有全新核酸操纵机制的基因组编辑工具,并推动其在作物中的应用。
        2. 环境响应的玉米智能株型设计。解析玉米驯化与环境适应性进化过程中遗传元件的演化规律,结合多组学和人工智能方法,挖掘调控株型形成与密植适应性的关键遗传元件;利用基因组编辑进行精准改造,设计环境响应的玉米智能株型。
    近期招聘信息
        现因研究发展需要,课题组目前正在招聘助理工程师/工程师、博士后(特别研究助理)、助理研究员/副研究员、博士和硕士研究生、客座研究生等。我们诚挚邀请对基因组编辑、人工智能与生物信息学、遗传元件挖掘、玉米遗传育种等领域感兴趣的优秀青年加盟团队,共同挖掘生命进化中的新型遗传元件,发展下一代核酸操纵方法,设计玉米智能株型,推动生物育种创新!

    社会任职:

    获奖及荣誉:

    承担科研项目情况:

    代表论著:

    代表性论文 (* Corresponding author; 1 co-first author)
    1.  Jin S1, Zhu Z1, Li YJ1, Zhang S1, Liu Y, Li D, Li YQ, Luo Y, Cheng Z, Zhao T, Yang G, Gao Q, Li H, Liang R, Qiu J-L, Zhang Y*, Liu JG*, Gao C* (2025) Functional RNA splitting drove the evolutionary emergence of type V CRISPR-Cas systems from transposons, Cell, 188(22):6283-6300.e22.
    2.  Liu G1, Lin Q1, Jin S1, and Gao C* (2022) The CRISPR-Cas toolbox and gene editing technologies. Molecular Cell, 82, 333-347.
    3.  Jin S1, Lin Q1, Gao Q and Gao C* (2022) Optimized prime editing in monocot plants using PlantPegDesigner and ePPEs, Nature Protocols, 18, 831–853.
    4.  Jin S1, Gao Q, Gao C* (2021) An unbiased method for evaluating the genome-wide specificity of base editors in rice, Nature Protocols, 16(1):431-457.
    5.  Lin Q1, Jin S1, Zong Y1, Yu H1, Zhu Z, Kou L, Wang Y, Li J*, Gao C* (2021) High-efficiency prime editing with optimized, paired pegRNAs in plants, Nature Biotechnology, 39, 923-927.
    6.  Jin S1, Lin Q1, Luo Y1, Zhu Z1, Liu G, Li Y, Chen K, Qiu J-L*, Gao C* (2021) Genome-wide specificity of prime editors in plants, Nature Biotechnology, 39, 1292–1299.
    7.  Jin S1, Fei H1, Zhu Z1, Luo Y1, Liu J, Gao S, Zhang F, Chen Y, Wang Y* and Gao C* (2020) Rationally designed APOBEC3B cytosine base editors with improved specificity. Molecular Cell, 79,728-740.
    8.  Jin S1, Zong Y1, Gao Q1, Zhu Z, Wang Y, Qin P, Liang C, Wang D, Qiu J-L, Zhang F, Gao C* (2019) Cytosine, but not adenine, base editors induce genome-wide off-target mutations in rice. Science, 364, 292–295.
    其他论文(* Corresponding author; 1 co-first author)
    9.  Zhu Z, Gao Quan, Gao Qiang, Jia H, Wang Z, He M, Li L, Zhang L, Li S, Jin S, Gao C, Zhao KT* (2025) Directed evolution of a compact TranC11a system for efficient genome editing. bioRxiv, doi: https://doi.org/10.1101/2025.09.28.678669.
    10.  Zhang S1, Sun A1, Qian J1, Lin S1, Xing W, Yang Y, Zhu HZ, Zhou X, Guo YS, Liu Y, Meng Y, Jin S, Song W, Li C, Li Z, Jin S, Wang J, Dong M, Gao C, Chen C, Bai Y, Liu JG* (2024) Pro-CRISPR PcrIIC1-associated Cas9 system for enhanced bacterial
    immunity. Nature, doi: 10.1038/s41586-024-07486-x.
    11.  Liu Z1, Zhang S1, Zhu H1, Chen Z1, Yang Y1, Li L1, Lei Y, Liu Y, Li D, Sun A, Li C, Tan S, Wang G, Shen J, Jin S, Gao C, Liu JG* (2023) Hydrolytic endonucleolytic ribozyme (HYER) is programmable for sequence-specific DNA cleavage. Science, doi: 10.1126/science.adh4859.
    12.  Li C1, Zong Y1, Jin S, Zhu H, Lin D, Li S, Qiu J-L, Wang Y*, Gao C* (2020) SWISS: multiplexed orthogonal genome editing in plants with a Cas9 nickase and engineered CRISPR RNA scaffolds. Genome Biology, 21(1):141.
    13.  Lin Q1, Zong Y1, Xue C1, Wang S, Jin S, Zhu Z, Wang Y, Anzalone AV, Raguram A, Doman JL, Liu DR, Gao C* (2020) Prime genome editing in rice and wheat. Nature Biotechnology, 38, 582-585.
    14.  Li C1, Zong Y1, Wang Y1, Jin S, Zhang D, Song Q, Zhang R, Gao C* (2018) Expanded base editing in rice and wheat using a Cas9-adenosine deaminase fusion. Genome Biology, 19, 59.
    15.  Zong Y1, Song Q1, Li C, Jin S, Zhang D, Wang Y, Qiu J-L, Gao C* (2018) Efficient C-to-T base editing in plants using a fusion of nCas9 and human APOBEC3A. Nature Biotechnology, 36, 950-953.