主要研究内容：
1. 基因组组装和泛基因组构建。结合最新的单分子测序技术、BioNano单分子图谱、Hi-C测序等，构建高质量基因组，或进一步构建泛基因组。已构建多个水稻、小麦、大豆、苦荞、金鱼草、高粱、番茄等基因组，并构建了大豆和水稻两个物种的高质量泛基因组。
2. 比较基因组和群体基因组分析。对水稻、小麦、苦荞、金鱼草等多个物种进行了比较基因组分析，发现了各个物种在进化上的一些关键特征的相关基因组基础，比如小麦基因组的快速变异导致的基因丢失、苦荞和金鱼草的全基因组复制后产生的对环境适应能力的增强或关键性状的演化。通过对中国主栽水稻品种的大规模群体基因组分析和GWAS，发现一些当前水稻育种中有利等位基因在不同群体间的渗入和利用特点。
3. 生物信息软件和数据库开发。在基因组组装方面，开发了一个基于单分子长片段测序的组装基因组复杂区域的软件HERA，在已有软件的基础上大大提高了基因组的组装质量，也提高了分离高杂合二倍体基因组的能力。在基因注释方面对Gramene-pipeline进行了改进。在数据库建设方面，构建了一个包括多个参考基因组、基因组注释和群体遗传多态信息，应用于功能基因组研究和分子育种的知识库MBKbase（www.mbkbase.org）。
个人简介：
1989年毕业于武汉大学获得遗传学学士学位，1995年于中科院遗传所获得遗传学博士学位，2001在加拿大Waterloo大学获得数学与计算机科学硕士学位。2001-2012年先后在加拿大Bioinformatics Solutions Inc公司、美国纽约冷泉港实验室、菲律宾国际水稻所从事生物信息研发工作。2012年2月起，任中科院遗传发育所研究员，入选中科院“引进杰出技术人才”计划，现担任研究所科学数据中心主任。
教育经历：
1989，学士，遗传学，武汉大学。
1995，博士，遗传学，中国科学院遗传研究所。
2001，硕士，数学与计算机科学,加拿大滑铁卢大学 (U. Waterloo)。
工作经历：
2012.02–现在 中国科学院遗传与发育生物学研究所 研究员
2012.02–现在 中国科学院遗传与发育生物学研究所 先后任基因组分析平台首席科学家、生物大数据分析平台首席科学家、科学数据中心主任
2015.10–现在 中国科学院大学 岗位教授
2009.12–2012.02 菲律宾国际水稻所 科学家（Scientist I / Crop Information Systems Specialist）
2004.10–2009.11 美国冷泉港实验室 科技信息主管（Scientific Informatics Manager I / Scientific Programmer）
2003.07–2004.10 美国马里兰大学生物技术研究所 助理研究员（Research Associate）
2001.07–2003.06 加拿大生物信息方案公司 生物信息科学家（Bioinformatics Scientist）
1996.06–1998.12 美国普渡大学昆虫系 博士后研究助理（Postdoctoral Research Associate）
奖励荣誉：
2020、2021年度中科院优秀导师奖。
培养的部分学生及去向：
杜会龙（2020年毕业），河北大学，教授
李秀秀（2020年毕业），福建农林大学，副教授
